Генеральный секретарь в установленном законодательством порядке отвечает за осуществление полномочий государственного органа, осуществление организационных, финансово-экономических функций управления персоналом и участие в гражданско-правовых отношениях.
Генеральному секретарю подотчетны профессиональные структурные подразделения, поддерживающие комитет.
Генеральный секретарь:
1) без доверенности в предусмотренных законом случаях и порядке выступает от имени Республики Армения и представляет его интересы, заключает сделки, выдает доверенности по вопросам, отнесенным к его компетенции
2) в порядке, установленном законом, иными правовыми актами и Уставом комитета, распоряжается закрепленным за Комитетом государственным имуществом, в том числе финансовыми средствами
3) в предусмотренных законом случаях назначает и освобождает соответствующих работников государственного органа, применяет к ним меры поощрения и назначает дисциплинарные взыскания
4) представляет руководителю государственного органа предложения по организационным вопросам работ структурных подразделений и офисов государственного органа.